رجح علماء متخصصون في علوم الاحياء والجيولوجيا ان اصل الحياة على كوكب الارض بدأ في المناطق المظلمة من الكوكب، اي في قعر المحيطات او على عمق كيلومترات تحت سطح الارض، حيث تنشط حياة جرثومية كبيرة.  ويقول روبرت هازن المتخصص في الجيوفيزياء (فيزياء باطن الارض) والباحث في معهد كارنيغي في واشنطن "ان الحياة الجرثومية موجودة في كل مكان على كوكب الارض، سواء على عمق سنتيمترات قليلة فقط من سطحها، او على عمق كيلومترات عدة".  وقد تم العثور على دود صغير في شقوق على عمق 1300 متر عن سطح الارض، في احد مناجم جنوب افريقيا، كما ان الحفر على عمق ستة كيلومترات في احد مناجم الصين اظهر وجود كائنات حية دقيقة، بحسب هازان.  غير ان اشكال الحياة الاكثر غموضا هي الفيروسات التي تعيش في قعر المحيطات، وقد تكون هذه الجراثيم ذات دور مهم في التنوع الجرثومي من خلال دخولها في جينومات (مجينات) الكائنات الدقيقة، بحسب ما يقول جون باروس استاذ علم الاحياء البيئي في جامعة واشنطن.