شغل محمد البواردي منصب وكيل وزارة الدفاع في دولة الإمارات العربية المتحدة، بالإضافة إلى كونه رئيس لجنة أبوظبي لتطوير التكنولوجيا، وأيضًا رئيس لجنة وضع وتنفيذ الاستراتيجية المائية والزراعية بإمارة أبوظبي، كما يشغل منصب نائب رئيس مجلس إدارة شركة "دولفين للطاقة".

ويذكر أن محمد البواردي هو عضو في مجلس إدارة شركة "توازن القابضة"، وهو العضو المنتدب في مجلس إدارة هيئة البيئة في أبوظبي، كما أنه نائب رئيس مجلس أمناء صندوق محمد بن زايد للمحافظة على الكائنات الحية، ونائب رئيس مجلس إدارة الصندوق الدولي للحفاظ على الحبارى. وهو الصندوق الذي أصدر الشيخ محمد بن زايد آل نهيان، ولي عهد أبوظبي نائب القائد الأعلى للقوات المسلحة، قرارًا بتشكيله في عام 2014 للحفاظ على الحبارى.