تحتوى زهرة البابونج على العديد من الفوائد الصحية لعلاج بعض الأمراض مثل علاج القلق والاكتئاب وعلاج الأرق وأمراض جلدية ، وقرحة المعدة، واضطرابات الجهاز الهضمى، والجروح، وعلاج التهاب المفاصل، والتخلص من آلام الروماتيزم، ويوضح تقرير نشره موقع أمريكى " draxe" هذه الفوائد كالتالى:

 القلق والاكتئاب
يساعد تناول البابونج، على مكافحة الإجهاد والقلق والاكتئاب، وكثيراً مايستخدم البابونج مهدئا للأعصاب

 تحسين عملية الهضم
يساعد تناول البابونج على استرخاء وعلاج اضطرابات الجهاز الهضمى، الغازات ،عسر الهضم، والإسهال، وفقدان الشهية، والدوار ، والغثيان والقيء.

يساعد  البابونج على علاج  الإسهال والمغص عند الأطفال ، ويحتوي زيت البابونج أيضا على مركبات أنودين هي مضادة للتشنج، ، وتساعد على علاج الإمساك وآلام المعدة الأخرى.